234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0485 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  44.2 
 
 		 1102 aa  826    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  42.45 
 
 		 1000 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  43.63 
 
 		 1112 aa  825    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  44.26 
 
 		 1009 aa  732    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  42.77 
 
 		 1027 aa  710    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  44.43 
 
 		 1063 aa  844    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  40.04 
 
 		 1079 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1081 aa  859    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  41.2 
 
 		 1085 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  62.34 
 
 		 1039 aa  1333    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  39.48 
 
 		 984 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  47.42 
 
 		 1041 aa  858    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  43.47 
 
 		 1073 aa  761    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  45.89 
 
 		 1067 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1008 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  40.43 
 
 		 1029 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  45.4 
 
 		 1087 aa  873    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  39.54 
 
 		 1078 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  46.02 
 
 		 1060 aa  897    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  46.17 
 
 		 1069 aa  891    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 1039 aa  2143    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  40.41 
 
 		 1007 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  45.52 
 
 		 1035 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  38.57 
 
 		 1012 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  45.67 
 
 		 1051 aa  767    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  46.23 
 
 		 1059 aa  876    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  48.9 
 
 		 1052 aa  954    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  67.05 
 
 		 1033 aa  1397    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  50.44 
 
 		 905 aa  868    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  38.51 
 
 		 1009 aa  635  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  38.99 
 
 		 989 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  39.86 
 
 		 965 aa  623  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.67 
 
 		 985 aa  621  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  40.08 
 
 		 1022 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.91 
 
 		 1004 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  38.29 
 
 		 1010 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  37.82 
 
 		 992 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  38.61 
 
 		 1006 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  37.78 
 
 		 971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  33.65 
 
 		 1035 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  35.51 
 
 		 1142 aa  559  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  37.34 
 
 		 997 aa  555  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 990 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  36.38 
 
 		 999 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  36.22 
 
 		 1067 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  35.16 
 
 		 991 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  36.31 
 
 		 983 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  34.79 
 
 		 969 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  39.07 
 
 		 976 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  35.29 
 
 		 1023 aa  493  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  36.02 
 
 		 1002 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1031 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  35.18 
 
 		 1011 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  34.54 
 
 		 1016 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  34.53 
 
 		 1023 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  34.47 
 
 		 1034 aa  446  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  34.22 
 
 		 1022 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  58.69 
 
 		 313 aa  250  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.09 
 
 		 1084 aa  109  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  26.01 
 
 		 1289 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2256  type I restriction-modification system, R subunit  24.43 
 
 		 1061 aa  105  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.24 
 
 		 986 aa  104  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.35 
 
 		 1079 aa  104  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  24.01 
 
 		 1059 aa  104  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.38 
 
 		 1074 aa  103  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.36 
 
 		 1031 aa  102  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  21.82 
 
 		 1067 aa  101  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.42 
 
 		 1035 aa  99.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.08 
 
 		 1040 aa  99  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.2 
 
 		 1034 aa  98.2  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.72 
 
 		 1042 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175068  normal  0.39911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4010  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.56 
 
 		 1067 aa  97.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3349  type I restriction-modification system R subunit  23.05 
 
 		 963 aa  95.5  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.531995  normal  0.015033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.52 
 
 		 1003 aa  95.1  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0037  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.88 
 
 		 1061 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.36 
 
 		 1003 aa  94.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.48 
 
 		 1068 aa  92.8  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.27 
 
 		 1044 aa  92.8  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.13 
 
 		 1029 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.07 
 
 		 1044 aa  93.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2507  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.04 
 
 		 1068 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351896  normal  0.319546 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.08 
 
 		 1024 aa  92.8  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.6 
 
 		 1052 aa  92.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  25.46 
 
 		 1061 aa  92  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.29 
 
 		 1030 aa  92  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4621  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23 
 
 		 1028 aa  91.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.250071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  25.75 
 
 		 1040 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.64 
 
 		 1023 aa  90.5  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.11 
 
 		 1029 aa  90.9  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.96 
 
 		 1084 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  23.58 
 
 		 1060 aa  89  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1156  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.94 
 
 		 974 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  24.44 
 
 		 984 aa  88.6  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2197  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.41 
 
 		 1063 aa  89  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.511328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3606  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.17 
 
 		 1000 aa  89  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.06 
 
 		 967 aa  88.6  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.06 
 
 		 967 aa  88.6  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.09 
 
 		 1084 aa  88.6  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.19 
 
 		 855 aa  88.2  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  26.07 
 
 		 1051 aa  87.8  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>