176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0476 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  100 
 
 		 182 aa  338  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  66.49 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  58.79 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  46.2 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  54.29 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  40.83 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  44.63 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  44.63 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  54.02 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  53.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  41.98 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.98 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  46.75 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  37.65 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.32 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  40.34 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.56 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.5 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  38.2 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  42.94 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  44 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  38.15 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  45.78 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  42.68 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  44.58 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.52 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  43.98 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  43.62 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.71 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  43.37 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  34.9 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  37.65 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.72 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  37.64 
 
 		 194 aa  87.4  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.78 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  40.44 
 
 		 235 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  39.39 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  37.36 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.33 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.39 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.24 
 
 		 231 aa  84.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  37.21 
 
 		 197 aa  84.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.01 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  43.75 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  37.34 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  37.43 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  43.75 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  40.28 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  40 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  44.16 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  34.64 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  37.65 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.08 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  42.86 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  40.36 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  41.52 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  39.01 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  34.64 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  40.24 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  38.65 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  41.52 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40.37 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  37.27 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  40.91 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.88 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  42.86 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  34.66 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  49.48 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  33.33 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  38.41 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  32.93 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  45.21 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  39.22 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.42 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  42.19 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  32.12 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  46.3 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  40.25 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  32.12 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  47.62 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.01 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  31.39 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  34.68 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  41.22 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.66 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.66 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.66 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  31.39 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  33.93 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  30.66 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  45.19 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  33.12 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  41.67 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  40.7 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.6 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.6 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  29.93 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>