More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0465 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  100 
 
 
399 aa  793    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  53.88 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  46.91 
 
 
468 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  46.95 
 
 
432 aa  295  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  41.1 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  40 
 
 
368 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  40.41 
 
 
399 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  31.65 
 
 
414 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  34.36 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  37.42 
 
 
416 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  30.46 
 
 
414 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  31.79 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  32.72 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  33.42 
 
 
413 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.38 
 
 
416 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 
428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  30.91 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  32.87 
 
 
299 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  37.64 
 
 
412 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  31.76 
 
 
421 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  31.6 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  35.57 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.55 
 
 
484 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.32 
 
 
656 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.55 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.86 
 
 
663 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  36.06 
 
 
412 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.74 
 
 
431 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  29.1 
 
 
413 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  29.25 
 
 
373 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.14 
 
 
444 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  28.41 
 
 
451 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  26.86 
 
 
384 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.14 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.91 
 
 
447 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.91 
 
 
443 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.1 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  28.49 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  28.71 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  26.53 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.26 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  32.91 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  30.29 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.34 
 
 
441 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.93 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  26.82 
 
 
663 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.94 
 
 
443 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.06 
 
 
444 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  30.63 
 
 
440 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.59 
 
 
660 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.34 
 
 
432 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  31.54 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.8 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  24.4 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.99 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  28.02 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.99 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.57 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  28.35 
 
 
478 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.99 
 
 
435 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.19 
 
 
455 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.99 
 
 
435 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.68 
 
 
447 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.23 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  26.26 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  26.26 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.84 
 
 
444 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.26 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  28.45 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.93 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25.73 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  25.73 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25.73 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.82 
 
 
448 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  24 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.37 
 
 
449 aa  89.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.53 
 
 
434 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  26.67 
 
 
441 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.86 
 
 
446 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  26.67 
 
 
441 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  28.61 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  22.88 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.92 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.81 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.45 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.91 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.96 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.96 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  31.56 
 
 
429 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.02 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.77 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  36.98 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  42.74 
 
 
442 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.75 
 
 
452 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  30.94 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.74 
 
 
442 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.83 
 
 
452 aa  86.3  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  25.58 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>