More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0370 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  100 
 
 		 382 aa  788    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  36.61 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  34.91 
 
 		 303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  29.69 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.78 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.49 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.25 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  27.81 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  35.17 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  29.41 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.25 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  27.59 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  26.17 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  26.95 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.09 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.7 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  27.33 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  29.05 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.94 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  25.41 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.44 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  28.3 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  29.19 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 1046 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.59 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  26.53 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  26.17 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  24.16 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  33.33 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3011  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  normal  0.0163533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  25.85 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  30.63 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  32.29 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 		 1162 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 1177 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 1177 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  23.5 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.51 
 
 		 247 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.75 
 
 		 244 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  24.83 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  22.86 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.11 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  35 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.11 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.14 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 232 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  27.59 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  25.93 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>