More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0359 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
568 aa  1157    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  48.25 
 
 
314 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
324 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  47.3 
 
 
314 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  49.06 
 
 
329 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 
337 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  46.23 
 
 
319 aa  296  9e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.84 
 
 
316 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 
344 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  48.26 
 
 
314 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 
342 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  46.25 
 
 
336 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 
320 aa  286  9e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  44.06 
 
 
321 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 
320 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 
337 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 
320 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  43.71 
 
 
320 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 
316 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  44.27 
 
 
320 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  44.87 
 
 
334 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  48.73 
 
 
335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  42.09 
 
 
325 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  47.4 
 
 
343 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  44.73 
 
 
329 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 
334 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 
320 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  43.03 
 
 
336 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  43.03 
 
 
336 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
320 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 
343 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  47.22 
 
 
343 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 
318 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
324 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
368 aa  263  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  40.81 
 
 
310 aa  257  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  42.01 
 
 
312 aa  257  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 
339 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  40.63 
 
 
313 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  44.1 
 
 
320 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.1 
 
 
320 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
336 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  44.17 
 
 
341 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 
310 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 
358 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  39.68 
 
 
310 aa  246  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 
338 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 
329 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 
314 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  39.63 
 
 
315 aa  243  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 
319 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  38.8 
 
 
347 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  40.82 
 
 
338 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  40.92 
 
 
332 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  40.33 
 
 
314 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
331 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
315 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
312 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  41.69 
 
 
302 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
331 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.27 
 
 
317 aa  224  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  42.75 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  46.79 
 
 
328 aa  223  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
243 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
318 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  44.72 
 
 
337 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  38.01 
 
 
317 aa  218  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  38.8 
 
 
313 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 
323 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
331 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
323 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
318 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.88 
 
 
240 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 
324 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  39.29 
 
 
324 aa  204  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  44.89 
 
 
240 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 
318 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  34.7 
 
 
331 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  47.32 
 
 
242 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.11 
 
 
237 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  36.39 
 
 
339 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
337 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  36.39 
 
 
339 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
312 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  43.1 
 
 
249 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  42.41 
 
 
237 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 
333 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
310 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
312 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
340 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
312 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.23 
 
 
327 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.91 
 
 
327 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>