272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0356 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  29.34 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  21.88 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.88 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.55 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.23 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.23 
 
 		 672 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.44 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  21.66 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.01 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.47 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  31.37 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.34 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.54 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  21.05 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.41 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.66 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.32 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  26.14 
 
 		 421 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  24.26 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.14 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.04 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  23.01 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.21 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.82 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.65 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.32 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.32 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.87 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.19 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.63 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.66 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  24.2 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.86 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.24 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.65 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.67 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 		 1177 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.29 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 785 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  27.14 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.85 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.19 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.37 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.87 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  20.6 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.9 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.92 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.93 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.9 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.64 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  20.6 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.98 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  28.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 996 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>