140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0326 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  58.9 
 
 
147 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  59.44 
 
 
146 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  42.86 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  42.28 
 
 
146 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  45.77 
 
 
149 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 
147 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  43.62 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  40.43 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  43.66 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  39.44 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  43.66 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  39.31 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  35.14 
 
 
148 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  36.96 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  37.59 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  42.2 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  42.2 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  38.1 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  38.69 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  40.19 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  35.97 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  35.17 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35.62 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  46.75 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  32.05 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  34.72 
 
 
318 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  48.68 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  48.05 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  48.05 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  48.05 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  48.05 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  52 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.37 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.08 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  37.17 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  44.44 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  40.3 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.85 
 
 
317 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  39.64 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  36.5 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  36.88 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  36.69 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  34.04 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  35.61 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  39.64 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  37.12 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  40 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  33.56 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  35.77 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  38.35 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  39.84 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  35.77 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  40.51 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  36.17 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  36.69 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.72 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  33.62 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  36.43 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  30.72 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.33 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  30.07 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  30.07 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  32.61 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  34.27 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  32.61 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  31.15 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  32.86 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 
144 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.15 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  30.22 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  38.46 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  27.71 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  26.62 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  40.85 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  26.51 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.26 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  30.66 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  36.05 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  26.28 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  32.11 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  26.28 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  27.01 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>