217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0258 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  82.76 
 
 		 210 aa  316  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  57.62 
 
 		 209 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  59.61 
 
 		 208 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  58.41 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  56.6 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  57.97 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  56.07 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  53.33 
 
 		 449 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  54.59 
 
 		 423 aa  224  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  50.72 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  55.34 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  55.56 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  51.36 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  51.82 
 
 		 245 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  54.46 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  54.5 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  53.67 
 
 		 220 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  53.5 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  54.42 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  54.42 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  53.95 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  53.95 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  53.5 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  53.03 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  54.23 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  53 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  55.17 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  52.5 
 
 		 207 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  51.15 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  50.99 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  50.7 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  51.98 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  50.25 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  52.85 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  51.26 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  48.33 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  51.52 
 
 		 449 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  53.03 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  51.46 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  50.76 
 
 		 464 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  46.63 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  50.97 
 
 		 444 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  48.02 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  51.01 
 
 		 462 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  46.46 
 
 		 426 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  49.25 
 
 		 460 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  45.45 
 
 		 401 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  51.22 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  42.93 
 
 		 419 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  44.95 
 
 		 423 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  42.86 
 
 		 450 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  42.86 
 
 		 415 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  42.86 
 
 		 450 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  40.38 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  40.38 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  47.46 
 
 		 405 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  38.46 
 
 		 427 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  37.74 
 
 		 417 aa  161  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  46.82 
 
 		 426 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  38.28 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  46.82 
 
 		 426 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  45.64 
 
 		 434 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  51.43 
 
 		 402 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  37.86 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  40.89 
 
 		 413 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  41.62 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  41.09 
 
 		 408 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  39.6 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  39.42 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  45.14 
 
 		 427 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  43.33 
 
 		 422 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  42.86 
 
 		 416 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  43.41 
 
 		 448 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  43.41 
 
 		 458 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  38.94 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  38.94 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 		 416 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  38.28 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  38.94 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  38.94 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  42.71 
 
 		 414 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  48.17 
 
 		 406 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  36.06 
 
 		 427 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  36.06 
 
 		 412 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  41.21 
 
 		 415 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  43.63 
 
 		 422 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  36.06 
 
 		 427 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  38.81 
 
 		 428 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>