More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0254 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  67.97 
 
 		 545 aa  758    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  67.9 
 
 		 542 aa  757    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 546 aa  1107    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  52.31 
 
 		 539 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 		 537 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  49.24 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  48.39 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  43.89 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  43.7 
 
 		 798 aa  435  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  44.95 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  43.31 
 
 		 668 aa  420  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.22 
 
 		 532 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  42.33 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.48 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.26 
 
 		 602 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.44 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.84 
 
 		 640 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  45.27 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 519 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  44.01 
 
 		 543 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  40.11 
 
 		 517 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 534 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 529 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 552 aa  359  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 525 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  41.17 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 533 aa  346  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 528 aa  336  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.83 
 
 		 585 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  36.36 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 582 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 		 639 aa  320  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 603 aa  319  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 603 aa  312  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 600 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 572 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 582 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 583 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 574 aa  300  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.34 
 
 		 591 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 578 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 577 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.41 
 
 		 554 aa  296  9e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.23 
 
 		 605 aa  294  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.73 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 573 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  34.69 
 
 		 562 aa  283  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.07 
 
 		 583 aa  282  9e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 584 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.85 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 582 aa  273  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  35.94 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  35.37 
 
 		 585 aa  270  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 593 aa  270  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.03 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 585 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 562 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 583 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.71 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.71 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 576 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 559 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.19 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.19 
 
 		 560 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.15 
 
 		 560 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>