More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0253 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  91.6 
 
 		 252 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  76.8 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  55.06 
 
 		 274 aa  241  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  53.25 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  53.69 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  50.62 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  47.3 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  45.88 
 
 		 295 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  44.49 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  44.49 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  42.51 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  41.03 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  45.45 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  41.38 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  42 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  46.55 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  46.81 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  46.55 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  46.81 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  41.63 
 
 		 295 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  43.32 
 
 		 275 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 		 284 aa  154  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  41.57 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  45.96 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  41.54 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  40.86 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  45.69 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  42.91 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  42.28 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  42.92 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  42.74 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  42.92 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  41.39 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  40.23 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  40.85 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  40.85 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  41.43 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  41.94 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  41.94 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  41.94 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  39.52 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  44.03 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  41.04 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  37.25 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  39.91 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  38.68 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  39.92 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  39.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  43.28 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  38.72 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  41.53 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  38.46 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  44.12 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  44.12 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  37.3 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  44.12 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  37.9 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  40.32 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  40.93 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  36.9 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  43.7 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  36.9 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  43.7 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  43.7 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  43.7 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  43.28 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  43.28 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  36.9 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  40 
 
 		 235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  37.6 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  43.28 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  38.17 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  42.24 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  38.17 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  40.85 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  36.14 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  37.2 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  39.44 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  37.94 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  38.4 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  43.84 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  41.1 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  38.43 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  37.7 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  34.48 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>