More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0206 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.83 
 
 		 953 aa  714    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  59.68 
 
 		 996 aa  1171    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.81 
 
 		 989 aa  720    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.7 
 
 		 981 aa  691    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.69 
 
 		 982 aa  654    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.93 
 
 		 996 aa  1108    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.54 
 
 		 996 aa  1119    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.51 
 
 		 1004 aa  642    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.49 
 
 		 989 aa  715    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.41 
 
 		 959 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  58.31 
 
 		 1020 aa  1135    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.17 
 
 		 993 aa  1346    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.17 
 
 		 996 aa  1145    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  74.52 
 
 		 993 aa  1514    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.31 
 
 		 966 aa  728    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  78.81 
 
 		 1004 aa  1610    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  56.73 
 
 		 996 aa  1102    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.9 
 
 		 999 aa  1367    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.78 
 
 		 979 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.68 
 
 		 973 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.49 
 
 		 989 aa  711    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.64 
 
 		 953 aa  697    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.28 
 
 		 953 aa  703    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.81 
 
 		 979 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  40.02 
 
 		 993 aa  686    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.33 
 
 		 1009 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  64.92 
 
 		 995 aa  1328    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.87 
 
 		 998 aa  750    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.47 
 
 		 996 aa  1104    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.48 
 
 		 985 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 993 aa  2036    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.37 
 
 		 996 aa  1134    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  39.6 
 
 		 1032 aa  629  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.81 
 
 		 1007 aa  626  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.26 
 
 		 947 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.42 
 
 		 945 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.49 
 
 		 800 aa  568  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.26 
 
 		 962 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.15 
 
 		 766 aa  555  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.41 
 
 		 946 aa  486  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.55 
 
 		 768 aa  412  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.21 
 
 		 765 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.07 
 
 		 758 aa  313  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.33 
 
 		 759 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.92 
 
 		 751 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.04 
 
 		 765 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.22 
 
 		 742 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.7 
 
 		 737 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.86 
 
 		 767 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.37 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.82 
 
 		 742 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.42 
 
 		 759 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.83 
 
 		 759 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.94 
 
 		 764 aa  301  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.42 
 
 		 807 aa  301  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  32.81 
 
 		 727 aa  300  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.01 
 
 		 741 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.29 
 
 		 774 aa  297  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.24 
 
 		 764 aa  296  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.39 
 
 		 752 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.57 
 
 		 761 aa  293  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.59 
 
 		 787 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.16 
 
 		 758 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.89 
 
 		 754 aa  292  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.64 
 
 		 737 aa  292  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.16 
 
 		 772 aa  290  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.91 
 
 		 739 aa  290  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.4 
 
 		 733 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.79 
 
 		 772 aa  287  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.5 
 
 		 775 aa  288  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.93 
 
 		 746 aa  288  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.56 
 
 		 769 aa  288  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.24 
 
 		 758 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.53 
 
 		 739 aa  287  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.15 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.33 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.65 
 
 		 739 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.74 
 
 		 740 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.81 
 
 		 739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.13 
 
 		 733 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.67 
 
 		 739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.67 
 
 		 739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.81 
 
 		 739 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.81 
 
 		 739 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.81 
 
 		 739 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.8 
 
 		 755 aa  284  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.81 
 
 		 761 aa  284  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.63 
 
 		 781 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.19 
 
 		 761 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 		 739 aa  283  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.13 
 
 		 761 aa  283  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34760  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  32.84 
 
 		 774 aa  283  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.51 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2920  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.52 
 
 		 799 aa  283  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0505784  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.97 
 
 		 764 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.31 
 
 		 738 aa  281  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.3 
 
 		 768 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.95 
 
 		 739 aa  280  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.3 
 
 		 768 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.24 
 
 		 741 aa  280  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>