More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0170 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  45.97 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  45.97 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  46.5 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 203 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  43.98 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 289 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 		 228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 244 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  37.22 
 
 		 182 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 186 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.79 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  36.13 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  35.6 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 182 aa  99  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32.34 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  37.77 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 181 aa  95.9  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 185 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  31.49 
 
 		 181 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 187 aa  95.1  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.94 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.94 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.83 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.73 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 199 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 199 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 199 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  34.55 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  31.12 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  34.46 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.56 
 
 		 184 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  37.36 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 		 342 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.98 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  32.61 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.21 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  26.11 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.7 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  31.54 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  34.95 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>