250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0099 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  74.88 
 
 		 215 aa  334  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  69.67 
 
 		 214 aa  287  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  58.33 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  53.55 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  49.76 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  46.95 
 
 		 232 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  43.98 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  43.52 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  43.52 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  43.52 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  44.91 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  44.44 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  43.52 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  43.52 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  43.52 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  43.06 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  45.67 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  41.71 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  39.34 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  43.81 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  38.86 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  43.69 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  40.58 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  45.27 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  43 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  44.78 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  41.26 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  41.75 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  47.6 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  45.59 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  43.2 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  42.23 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  43.75 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  45.02 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  39.44 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  41.63 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  41.26 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  40.78 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  43.69 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  43.2 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  40.76 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  41.75 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  41.06 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  45.02 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  39.42 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  37.02 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  40.1 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  42.72 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  43.29 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.6 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  39 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  39.23 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  38.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  38.21 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  38.21 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  38.57 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  43.81 
 
 		 518 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  39.23 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  39.71 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  41.71 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  38.68 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  38.68 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  38.68 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  38.68 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  42.03 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  44.23 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  38.68 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  37.32 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  41.18 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  40.87 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>