124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0097 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 419 aa  825    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  63.93 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  50.71 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  51.68 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  50.95 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  50.71 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  50.71 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  50.73 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  49.76 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  50.24 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  50.49 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  50.36 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  51.46 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  50.49 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  50.6 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  50.49 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  50.25 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  49.16 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  50.24 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  50.36 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  47.78 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  46.9 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  47.14 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  50.12 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  47.26 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  49.88 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  49.27 
 
 		 418 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  47.07 
 
 		 416 aa  363  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  46.51 
 
 		 414 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  46.25 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  46.25 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  45.74 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  45.48 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  45.48 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  45.22 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  44.96 
 
 		 414 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  38.59 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  38.59 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  38.59 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  38.59 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  38.59 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  38.35 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  38.59 
 
 		 415 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  38.35 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  38.88 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  41.32 
 
 		 411 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  32.75 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  36.94 
 
 		 395 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  35.32 
 
 		 395 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  36.41 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  35.34 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  36.15 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  35.34 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  35.08 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  34.81 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  35.62 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  33.5 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  33 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  33.5 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  34.81 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  32.8 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  31.22 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  34.72 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  30.95 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  32.24 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  35.42 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  32.32 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  32.49 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  32.49 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  32.49 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  33.92 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  33.07 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  31.02 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  31.59 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  29.02 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  31.41 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  30.23 
 
 		 391 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  31.73 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  32.09 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  31.82 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  30.53 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>