80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0095 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  80.62 
 
 
352 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  76.08 
 
 
349 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  57.06 
 
 
356 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  51.27 
 
 
361 aa  326  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  45.57 
 
 
362 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  41.57 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  34.3 
 
 
443 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  32.63 
 
 
426 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  34.76 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  33.55 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  34.56 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  31.83 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  31.6 
 
 
415 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  34.24 
 
 
346 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  32.13 
 
 
420 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  31.4 
 
 
427 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.11 
 
 
417 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  34.77 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  33.59 
 
 
307 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  28.48 
 
 
394 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.9 
 
 
350 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  32.82 
 
 
306 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.81 
 
 
350 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
354 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
346 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.84 
 
 
303 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  26.62 
 
 
356 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.37 
 
 
306 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  31.25 
 
 
339 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.37 
 
 
306 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  32.95 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 
307 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.01 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.27 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  32.78 
 
 
306 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  28.96 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  32.26 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  30.83 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.89 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  31.28 
 
 
308 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.93 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  31.85 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  31.05 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.83 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  31.33 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30.8 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30.8 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  30.43 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  29.69 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  29.79 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  29.34 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  28.82 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  26.56 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  33.86 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  31.23 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  31.6 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.83 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.78 
 
 
277 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 
265 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.75 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  23.1 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  31.82 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  25.27 
 
 
257 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  24.56 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  31.76 
 
 
306 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>