More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0089 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  100 
 
 
400 aa  811    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  42.2 
 
 
392 aa  249  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  38.48 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  36.1 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  37.13 
 
 
417 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  40.42 
 
 
381 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.61 
 
 
407 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  29.95 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  30.24 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  37.04 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  29.37 
 
 
414 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.92 
 
 
400 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  30.1 
 
 
372 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.81 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.37 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  32.61 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  37.04 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  29.24 
 
 
381 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  38.29 
 
 
429 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.13 
 
 
379 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  34.16 
 
 
338 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
159 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.04 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.27 
 
 
379 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.45 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  30.35 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  35.37 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  34.3 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  30.2 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  26.68 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  29.12 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.75 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.82 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.2 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.4 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  34.76 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.79 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  32.73 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  27.59 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.77 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.33 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.62 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.45 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  36.25 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.09 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  35.17 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  29.74 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  30.04 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.6 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  29.33 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.94 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.17 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  29.33 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30.36 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  33.86 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.47 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.21 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  25.71 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  26.52 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.88 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.19 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.79 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  25.67 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  25.83 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  25.83 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.36 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.7 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  31.54 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  27.24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.83 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.13 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.26 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  31.7 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.68 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29.95 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  25.82 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  25.82 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  29.95 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.11 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.85 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  28.92 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  32.09 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  29.14 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.44 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.29 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  29.32 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  21.96 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  32.63 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  29.96 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  26.5 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  28.57 
 
 
321 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  24.75 
 
 
481 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  29.44 
 
 
305 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  23.57 
 
 
349 aa  64.3  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  31.21 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.52 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  27.72 
 
 
333 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>