More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0077 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.53 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  49.17 
 
 
479 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 
480 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.6 
 
 
464 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.79 
 
 
474 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  40.84 
 
 
463 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.23 
 
 
465 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
466 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 
466 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  36.74 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 
466 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.72 
 
 
491 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 
464 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
473 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
466 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
466 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 
471 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  36.74 
 
 
466 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
466 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 
466 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
466 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 
466 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 
466 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 
466 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 
471 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  35.93 
 
 
463 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  35.78 
 
 
463 aa  316  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.92 
 
 
488 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 
470 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.37 
 
 
478 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  34.2 
 
 
473 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
490 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
477 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
459 aa  289  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
503 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.16 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  35.92 
 
 
503 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.34 
 
 
502 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 
502 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 
509 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.13 
 
 
475 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
509 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.27 
 
 
501 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.76 
 
 
515 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.24 
 
 
509 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.01 
 
 
593 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.97 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 
492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
513 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  34.98 
 
 
509 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 
506 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
507 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 
506 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 
509 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 
506 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  35.56 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.17 
 
 
523 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
517 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
506 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.91 
 
 
510 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
488 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
546 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
564 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
506 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
564 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
506 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  35.1 
 
 
488 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  34.26 
 
 
561 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
569 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
507 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  34.55 
 
 
507 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
507 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  33.54 
 
 
521 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.44 
 
 
504 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.57 
 
 
471 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  34.57 
 
 
511 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.85 
 
 
501 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
562 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  33.33 
 
 
520 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
485 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
490 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.27 
 
 
488 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  34.26 
 
 
564 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
564 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.92 
 
 
488 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.5 
 
 
501 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
475 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.04 
 
 
485 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
501 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>