More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0063 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  53.97 
 
 		 135 aa  129  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  54.47 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  48.03 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  48.31 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  48.31 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  42.02 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  43.75 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  40 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  41.46 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  41.46 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  41.46 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  44.04 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  41.46 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  41.82 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  40.65 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  36.97 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  37.84 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  38.61 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  38.61 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  38.78 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  37.62 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  33.93 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  36.08 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  36.08 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.08 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.08 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  35 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  36.08 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  35.05 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  37.11 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  36.08 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  36.08 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  31.53 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  31.53 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  34 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  36 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  35.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.63 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  30.63 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.63 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  30.63 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  34.02 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  35 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  32.11 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  26.42 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  34.38 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  27.64 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  27.93 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  30.09 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  29.36 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  27.36 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  45.83 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  37.65 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  38.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  32.63 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.98 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.63 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.98 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  34.41 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>