184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0053 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0053  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 
569 aa  1131    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350618  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2577  potassium-transporting ATPase subunit A  64.98 
 
 
612 aa  748    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  52.82 
 
 
567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  53.53 
 
 
567 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  55.52 
 
 
571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  55.08 
 
 
571 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  54.37 
 
 
571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  54.09 
 
 
571 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.59 
 
 
564 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  51.06 
 
 
567 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  52.75 
 
 
567 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.2 
 
 
569 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  53.04 
 
 
564 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  52.04 
 
 
567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  52.07 
 
 
562 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  52.07 
 
 
562 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  52.07 
 
 
562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  51.53 
 
 
561 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  51.86 
 
 
569 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  52.3 
 
 
567 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  52.08 
 
 
571 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  53.86 
 
 
559 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  53.86 
 
 
559 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  54.05 
 
 
559 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  51.06 
 
 
567 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  51.24 
 
 
567 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  53.67 
 
 
559 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  53.86 
 
 
559 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  53.26 
 
 
559 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  50.88 
 
 
579 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  55.16 
 
 
571 aa  554  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 
592 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  53.6 
 
 
562 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.16 
 
 
582 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  52.23 
 
 
557 aa  541  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  51.51 
 
 
567 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  51.34 
 
 
568 aa  545  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  52.23 
 
 
557 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  52.23 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.23 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  52.58 
 
 
564 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  51.2 
 
 
591 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  52.43 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  52.54 
 
 
564 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  52.23 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 
601 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  49.04 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1707  potassium-transporting ATPase subunit A  52.58 
 
 
564 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260767  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  52.04 
 
 
557 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  52.23 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  52.23 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  52.4 
 
 
564 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  48.46 
 
 
590 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  49.58 
 
 
605 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  51.33 
 
 
569 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3486  potassium-transporting ATPase subunit A  53.11 
 
 
564 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.87 
 
 
567 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  51.99 
 
 
564 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  48.54 
 
 
590 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  52.01 
 
 
576 aa  531  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  49.64 
 
 
574 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  51.81 
 
 
575 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  49.41 
 
 
592 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4033  potassium-transporting ATPase subunit A  52.22 
 
 
564 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.845156  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  47.84 
 
 
610 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  48.17 
 
 
578 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  48.37 
 
 
590 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  48.85 
 
 
586 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.79 
 
 
572 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  46.66 
 
 
592 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2927  potassium-transporting ATPase subunit A  51.62 
 
 
561 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.97 
 
 
572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  51.76 
 
 
569 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  52.85 
 
 
562 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  49.64 
 
 
599 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  46.57 
 
 
571 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1096  potassium-transporting ATPase subunit A  53.44 
 
 
568 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  46.22 
 
 
594 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  45.95 
 
 
601 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  45.95 
 
 
601 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.85 
 
 
811 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0717  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.05 
 
 
576 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000927315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  48.14 
 
 
595 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  45.61 
 
 
601 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1677  potassium-transporting ATPase subunit A  49.55 
 
 
583 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  45.95 
 
 
601 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  45.95 
 
 
601 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  45.95 
 
 
601 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4242  potassium-transporting ATPase subunit A  48.94 
 
 
569 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1265  potassium-transporting ATPase subunit A  51.73 
 
 
551 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2923  potassium-transporting ATPase subunit A  51.73 
 
 
551 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.519235  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0722  potassium-transporting ATPase, A subunit  47.97 
 
 
576 aa  488  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  46.42 
 
 
601 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  46.9 
 
 
602 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2383  potassium-transporting ATPase subunit A  48.33 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0895  potassium-transporting ATPase subunit A  49.29 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1083  potassium-transporting ATPase subunit A  45.88 
 
 
602 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0784  potassium-transporting ATPase subunit A  45.88 
 
 
602 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1241  potassium-transporting ATPase subunit A  45.88 
 
 
602 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1249  potassium-transporting ATPase subunit A  45.88 
 
 
602 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>