More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0002 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  42.86 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  44.08 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  36.18 
 
 		 140 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.53 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.17 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.1 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.41 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.8 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.24 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.29 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.38 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.68 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.55 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.92 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  33.54 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.19 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.11 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.52 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.24 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  30.52 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.46 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.95 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.92 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.46 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.03 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  30.77 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  25.32 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.56 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.33 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.57 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.76 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.35 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  30.87 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  28.76 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  30.87 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  28.12 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.37 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.49 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  32.47 
 
 		 309 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.67 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.14 
 
 		 294 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.87 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  25.32 
 
 		 345 aa  52  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.32 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.97 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  30.2 
 
 		 140 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.7 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.89 
 
 		 139 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 141 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.15 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.13 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.95 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.52 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  33.13 
 
 		 390 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.32 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.15 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  27.92 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.14 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.93 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.26 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  29.14 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  33.02 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>