235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3177 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 274 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  61.73 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  53.61 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  53.09 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  45.65 
 
 		 205 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  40.86 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  40.32 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  44.2 
 
 		 204 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.58 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  47.06 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  42.77 
 
 		 204 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.82 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  41.44 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  40.72 
 
 		 219 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  40.61 
 
 		 203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  42.22 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  41.44 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  38.33 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  42.11 
 
 		 213 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  35.14 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.03 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  43.09 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  43.09 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  43.09 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  43.09 
 
 		 204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  38.89 
 
 		 206 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  42.54 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  45.55 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  49.61 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  36.26 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  39.38 
 
 		 205 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  44.16 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  41.99 
 
 		 205 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  41.99 
 
 		 205 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  41.99 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  41.99 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.63 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  41.99 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  39.34 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  44.16 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  38.59 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  36.41 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  41.99 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  41.61 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  41.99 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  41.99 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  45.03 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  34.41 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  44.16 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  44.16 
 
 		 204 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.81 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  47.66 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  38.04 
 
 		 204 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  43.51 
 
 		 204 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  39.01 
 
 		 201 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  38.26 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  47.37 
 
 		 198 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  39.62 
 
 		 210 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.63 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  43.65 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  41.06 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  38.18 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  38.3 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.3 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  38.3 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  44.32 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  33.88 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  30.85 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  44.32 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.7 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.67 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  38.5 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  38.5 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.36 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.46 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  40.76 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  31.96 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  29.32 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.83 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  39.36 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.3 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.3 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.3 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  34.57 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  29.73 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  35.29 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  45.24 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  42.7 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  38.3 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  109  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  38.83 
 
 		 195 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  41.22 
 
 		 197 aa  109  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.7 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>