More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3157 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  100 
 
 		 458 aa  914    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0922  peptidase M23B  61.1 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.611629  normal  0.45806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  42.65 
 
 		 369 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  36.47 
 
 		 373 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  38.24 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  27.35 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  28.93 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.97 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.95 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.09 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.94 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.56 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.39 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.07 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  27.76 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  27.76 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  27.53 
 
 		 344 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  25.85 
 
 		 382 aa  93.6  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  40.88 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27.97 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35.48 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  26.73 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  28.79 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  35.53 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  26.61 
 
 		 377 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  23.78 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  26.26 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  42.52 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  26.11 
 
 		 387 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  37.3 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  34.81 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  34.81 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  36.84 
 
 		 394 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  25.75 
 
 		 362 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  33.61 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.82 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  36.36 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  27.2 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  31.25 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.39 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  23.24 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  27.06 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  28 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  32.56 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  31.78 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  37.1 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  37.6 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  34.43 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  32.83 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  32.79 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  32.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  32.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  32.79 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.02 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  32.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  32.79 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  32.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  32.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  28.18 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  32.52 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.75 
 
 		 509 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.58 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  31.01 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  35.48 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  27.72 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  33.33 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  35.48 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  35.48 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  35.48 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  28.88 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  25.65 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.31 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.88 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  25.84 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.31 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  34.65 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  36.29 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  29.47 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  28.35 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  33.87 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.39 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  27.87 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  35.48 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.68 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  38.89 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  32.33 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>