More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3151 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  92.56 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  85.54 
 
 		 242 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  75.62 
 
 		 242 aa  394  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  66.39 
 
 		 243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  67.22 
 
 		 243 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  64.85 
 
 		 247 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  66.12 
 
 		 244 aa  337  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  65.68 
 
 		 246 aa  337  8e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  64.26 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  65.56 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  65.42 
 
 		 242 aa  334  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  69.07 
 
 		 247 aa  334  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  69.07 
 
 		 247 aa  334  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  64.32 
 
 		 246 aa  333  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  63.75 
 
 		 253 aa  332  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  63.75 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  63.33 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.98 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.44 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  63.07 
 
 		 259 aa  329  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  63.9 
 
 		 251 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  63.9 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  64.58 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  64.02 
 
 		 249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.44 
 
 		 249 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  63.49 
 
 		 253 aa  327  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  63.6 
 
 		 258 aa  327  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  64.17 
 
 		 249 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  63.33 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  63.6 
 
 		 269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.68 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  64.02 
 
 		 268 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.42 
 
 		 244 aa  324  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  63.33 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.95 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.25 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  62.34 
 
 		 267 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  62.66 
 
 		 254 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.5 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  63.07 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  63.07 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  61.41 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  61.41 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  62.34 
 
 		 257 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  62.66 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  63.33 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  63.6 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  62.08 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.09 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.09 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  63.18 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  62.66 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  61.92 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  64.41 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.92 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  60.83 
 
 		 243 aa  317  9e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.67 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.83 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  63.4 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.67 
 
 		 263 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  59.75 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.92 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  314  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  314  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 247 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.02 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  60.25 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.55 
 
 		 243 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  60.25 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.83 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  60.67 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  62.5 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  60.25 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>