More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3137 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  67.63 
 
 		 273 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  54.01 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  51.87 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  52.03 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  55.24 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  50.95 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  52.66 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  54.59 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  51.16 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  48.05 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  49.53 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  43.58 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  43.6 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  43.6 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 254 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 403 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 		 411 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  39.91 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  44 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 		 395 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 440 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.31 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.22 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  39.34 
 
 		 242 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  44.23 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 456 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 453 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.36 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.27 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  40.26 
 
 		 254 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  38.03 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  37.09 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 		 541 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  39.82 
 
 		 568 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.25 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  39.21 
 
 		 226 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  36.36 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.99 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  42.86 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  45.2 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  40.61 
 
 		 582 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.99 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.74 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  35.14 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  40 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  34.43 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  40 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  43.24 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  42.39 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.22 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  39.56 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  34.08 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  35.62 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  35.62 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>