36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3113 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
589 aa  1192    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  46 
 
 
656 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  25.49 
 
 
629 aa  97.4  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  25.78 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  20.89 
 
 
648 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  20.75 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.63 
 
 
758 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  20.87 
 
 
671 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  17.84 
 
 
618 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  21.72 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  20.37 
 
 
616 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  20.32 
 
 
653 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  18.9 
 
 
604 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  21.15 
 
 
821 aa  57.4  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  25.3 
 
 
841 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.11 
 
 
647 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  20.65 
 
 
826 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  22.94 
 
 
649 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  18.68 
 
 
578 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  20.92 
 
 
626 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.57 
 
 
891 aa  51.6  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  20.39 
 
 
654 aa  50.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  26.27 
 
 
430 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.7 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  26.19 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  26.04 
 
 
442 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  17.88 
 
 
824 aa  47.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  23.34 
 
 
822 aa  47.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  21.08 
 
 
666 aa  47  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  27.49 
 
 
430 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  20.44 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  22.05 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  23.67 
 
 
433 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  22.02 
 
 
820 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.13 
 
 
446 aa  43.9  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>