More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3082 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
397 aa  791    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  55.87 
 
 
415 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  60.05 
 
 
399 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  42.97 
 
 
391 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  37.82 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  39.82 
 
 
365 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  35.47 
 
 
361 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  35.81 
 
 
361 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  37.76 
 
 
504 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  37.43 
 
 
361 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  33.9 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28.01 
 
 
358 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  29.83 
 
 
363 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.27 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 
379 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  30.32 
 
 
362 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  30.08 
 
 
376 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  28.12 
 
 
406 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  29.63 
 
 
352 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  33.24 
 
 
361 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  31.12 
 
 
346 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.23 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  31.48 
 
 
365 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.68 
 
 
363 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.49 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.53 
 
 
356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.47 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.62 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.51 
 
 
360 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  27.5 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  28.16 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  29.14 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  27.5 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.86 
 
 
371 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  33.19 
 
 
398 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  29.44 
 
 
339 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  32.89 
 
 
350 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  32.89 
 
 
353 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  27.58 
 
 
353 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  28.57 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.78 
 
 
354 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.36 
 
 
354 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
352 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  32.89 
 
 
355 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30.59 
 
 
384 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  32.89 
 
 
355 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  30.18 
 
 
356 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  27.22 
 
 
354 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  27.01 
 
 
398 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  27.69 
 
 
359 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  35.23 
 
 
353 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  31.33 
 
 
362 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 
360 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.86 
 
 
351 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.07 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.6 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.23 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  35.98 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.61 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.82 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  35.98 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  28.57 
 
 
358 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  33.17 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  25.83 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  28.84 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.49 
 
 
356 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  23.19 
 
 
355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  29.71 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  29.71 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  35.29 
 
 
358 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  32.35 
 
 
392 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  28.05 
 
 
372 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  28.05 
 
 
352 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  36.27 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  31.28 
 
 
350 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 
346 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  26.39 
 
 
355 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 
355 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.21 
 
 
362 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2836  hypothetical protein  29.93 
 
 
352 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93454  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  23.98 
 
 
345 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  26.32 
 
 
372 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  29 
 
 
381 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  25.59 
 
 
352 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  32.24 
 
 
370 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>