258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3032 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  32.87 
 
 
261 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  34.3 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  32.27 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  36.15 
 
 
261 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  31.22 
 
 
262 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  34.1 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
237 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  31.8 
 
 
269 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  34.84 
 
 
262 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  34.43 
 
 
261 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  31.16 
 
 
263 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  38.67 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  30.45 
 
 
273 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  36.72 
 
 
242 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
268 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  29.41 
 
 
238 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.36 
 
 
250 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  29.41 
 
 
238 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
242 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  30.32 
 
 
261 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  29.65 
 
 
262 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  34.27 
 
 
264 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  29.38 
 
 
238 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  31.65 
 
 
263 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  31.63 
 
 
239 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  30.23 
 
 
270 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  32.97 
 
 
262 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 
246 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  30.73 
 
 
263 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 
263 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  29.38 
 
 
238 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.74 
 
 
263 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  34.3 
 
 
241 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
241 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  27.23 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  30.37 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  30.66 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.8 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  30.66 
 
 
241 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  37.36 
 
 
234 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  26.19 
 
 
245 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  33.07 
 
 
356 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 
243 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  33.75 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  33.16 
 
 
237 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  32.17 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  29.54 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.07 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
267 aa  89  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  31.75 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  31.1 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 
271 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
265 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 
280 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  35.14 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  32.22 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 
241 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 
234 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  30.11 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  25.44 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.55 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  25.53 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  25.53 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  25.53 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  25.53 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  25.18 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 
271 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  22.91 
 
 
247 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  25.53 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.93 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  22.91 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  23.94 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>