More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3016 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  751    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.95 
 
 
392 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  48.05 
 
 
367 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
399 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.47 
 
 
366 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
403 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
391 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.26 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
378 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
385 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 
402 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
365 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
412 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
453 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  31 
 
 
383 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  31.62 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
409 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
398 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
390 aa  85.9  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.03 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.13 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
821 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
358 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.77 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32.13 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.83 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  33.48 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.39 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  27.88 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
822 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
819 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>