More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3007 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
213 aa  414  1e-115  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.5 
 
 
215 aa  261  5e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.35 
 
 
219 aa  235  5e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.38 
 
 
219 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.61 
 
 
211 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.7 
 
 
224 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.8 
 
 
219 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  52.24 
 
 
209 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.37 
 
 
223 aa  199  4e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  53.03 
 
 
204 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.99 
 
 
204 aa  191  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.46 
 
 
206 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.66 
 
 
221 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.13 
 
 
220 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.51 
 
 
213 aa  179  3e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.49 
 
 
206 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
207 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.76 
 
 
205 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43 
 
 
208 aa  165  6e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.25 
 
 
210 aa  163  2e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
211 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.63 
 
 
211 aa  162  5e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
206 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
210 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.73 
 
 
236 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1867  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.08 
 
 
211 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0796914  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.91 
 
 
211 aa  156  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.5 
 
 
211 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.76 
 
 
221 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
220 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.94 
 
 
228 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.87 
 
 
204 aa  147  2e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4969  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.08 
 
 
231 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
197 aa  145  4e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4940  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.9 
 
 
233 aa  145  4e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.79 
 
 
215 aa  145  4e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
214 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
214 aa  143  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
220 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  44.22 
 
 
478 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0584  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.2 
 
 
203 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.143376  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  43.37 
 
 
213 aa  140  1e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.79 
 
 
223 aa  139  4e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.44 
 
 
211 aa  139  4e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5050  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5185  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.42 
 
 
228 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.08 
 
 
216 aa  137  9e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  39.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10472  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08970)  44.44 
 
 
519 aa  134  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182627  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.39 
 
 
222 aa  134  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.75 
 
 
352 aa  133  2e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
352 aa  133  2e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03710  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative  39.55 
 
 
555 aa  132  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.036727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 
479 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.82 
 
 
208 aa  132  4e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.69 
 
 
211 aa  132  4e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.2 
 
 
211 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.71 
 
 
217 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 
207 aa  131  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
216 aa  131  7e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
216 aa  131  7e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
344 aa  131  8e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
218 aa  131  8e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.7745e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  34.93 
 
 
210 aa  131  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  9.01813e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
224 aa  130  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
203 aa  130  1e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.5 
 
 
219 aa  130  1e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
218 aa  129  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
352 aa  130  2e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
492 aa  130  2e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
218 aa  130  2e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
219 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.34 
 
 
206 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.62 
 
 
211 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
219 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  39.55 
 
 
533 aa  129  4e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.44 
 
 
217 aa  129  5e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.11 
 
 
356 aa  128  5e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  127  8e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 
352 aa  127  9e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2301  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.65 
 
 
203 aa  127  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.127394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0648  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.65 
 
 
203 aa  127  1e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 
212 aa  126  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
215 aa  127  2e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
219 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
219 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
490 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
207 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  39.05 
 
 
206 aa  125  4e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 
207 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
213 aa  124  8e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
350 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.07 
 
 
226 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4471  thiamine-phosphate diphosphorylase  49.09 
 
 
241 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.23 
 
 
219 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.97058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
217 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.88 
 
 
206 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4935  Thiamine-phosphate diphosphorylase  49.09 
 
 
241 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539276  normal  0.373697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>