92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3004 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  64.71 
 
 		 157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  59.48 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.03 
 
 		 157 aa  141  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.05 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.38 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.83 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  38.57 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.33 
 
 		 216 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.21 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.33 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.2 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  30.56 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  30.56 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  30.56 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  30.56 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  30.56 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.87 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  31.54 
 
 		 233 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.87 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.48 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.4 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  29.13 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.33 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13006  hypothetical protein  26.03 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0109972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3814  PPOX class putative F420-dependent enzyme  26.24 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.66 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  24.5 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.03 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.42 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  27.42 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.72 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  24.59 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2533  PPOX class putative F420-dependent enzyme  34.85 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.49 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0791  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.36 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.81 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3705  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.82 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5179  putative flavin-nucleotide-binding protein  30 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0524  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  28.68 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  30 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.06 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0501649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0051  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  28.06 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.06 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.0534302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.32 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.3 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3192  hypothetical protein  39.13 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  27.4 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.33 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  25.78 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0831  putative F420-dependent enzyme  31.78 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.981538  decreased coverage  0.00628488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3285  PPOX class putative F420-dependent enzyme  31 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related protein FMN-binding  36.21 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.428154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1437  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.16 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6484  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.38 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5438  putative F420-dependent enzyme  29.37 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  27.21 
 
 		 223 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  24.78 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  35.85 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.34 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3217  PPOX class putative F420-dependent enzyme  21.74 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.732162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  28.23 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  25.81 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.06 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.7 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000026689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  33.7 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  25.78 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.28 
 
 		 210 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  23.58 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1506  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.7 
 
 		 141 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0550  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.21 
 
 		 130 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0267211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4839  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  47.73 
 
 		 132 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  28.36 
 
 		 212 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8501  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2143  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  25 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.95 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1056  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  26.32 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.991641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6357  PPOX class putative F420-dependent enzyme  25.52 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>