More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3003 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 394 aa  812    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  51.28 
 
 		 396 aa  441  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  53.32 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  51.4 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  51.15 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  49.48 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  47.8 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  47.4 
 
 		 404 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  47.55 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  47.41 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  47.59 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  46.74 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  47.29 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  47.29 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  46.21 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  46.21 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  47.41 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  44.79 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  44.79 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  46.6 
 
 		 406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  48.77 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 397 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  44.67 
 
 		 420 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  45.29 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 398 aa  326  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  49.07 
 
 		 416 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  42.63 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  45.8 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.16 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  45.22 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  47.71 
 
 		 426 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 402 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  41.31 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.28 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  39.6 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  43.98 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.02 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  39.48 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  38.05 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  41.75 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.39 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.4 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.4 
 
 		 410 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  40.45 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  41.69 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 413 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 436 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  41.58 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.68 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>