More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2993 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 502 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 504 aa  698    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  82.63 
 
 		 532 aa  870    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  75.45 
 
 		 503 aa  792    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  85.23 
 
 		 501 aa  901    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1035    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  57.93 
 
 		 491 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 492 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 494 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 492 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 511 aa  541  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 484 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 493 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 501 aa  525  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  51.21 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  53.69 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  53.48 
 
 		 496 aa  512  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 507 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.21 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 514 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 496 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 496 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 508 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 515 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 515 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 505 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>