232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2989 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
460 aa  897    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  55.45 
 
 
450 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  50.56 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  49.2 
 
 
455 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  46.45 
 
 
438 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.82 
 
 
390 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.97 
 
 
391 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  46.19 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.52 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  50.57 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  46.39 
 
 
436 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  46.14 
 
 
451 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.54 
 
 
398 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  42.99 
 
 
444 aa  330  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.89 
 
 
396 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.19 
 
 
409 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.04 
 
 
394 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.22 
 
 
382 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  43.96 
 
 
424 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.94 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  40.47 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 
397 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.52 
 
 
394 aa  319  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 
400 aa  319  7.999999999999999e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.28 
 
 
394 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.52 
 
 
394 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.29 
 
 
382 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  40.13 
 
 
464 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
388 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
388 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
388 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
388 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.06 
 
 
391 aa  316  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
388 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.86 
 
 
389 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  43.13 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.86 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.86 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  46.32 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.86 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  46.93 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  41.72 
 
 
408 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  39.38 
 
 
386 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  42.07 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  46.28 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  44.26 
 
 
438 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 
388 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.77 
 
 
396 aa  309  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.37 
 
 
391 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  39.77 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.33 
 
 
391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.19 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.19 
 
 
397 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  40.18 
 
 
450 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  44 
 
 
388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.56 
 
 
389 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  40.74 
 
 
383 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.79 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  42.44 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  42.31 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  44.01 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  45.6 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  41.26 
 
 
475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  46.3 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.42 
 
 
395 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  42.73 
 
 
456 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  39.81 
 
 
382 aa  302  9e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.92 
 
 
392 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  42.34 
 
 
444 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  43.05 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  42.82 
 
 
401 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.06 
 
 
389 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.06 
 
 
389 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  40.87 
 
 
398 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.43 
 
 
391 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.66 
 
 
391 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.73 
 
 
389 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  41.01 
 
 
446 aa  299  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.27 
 
 
399 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.36 
 
 
397 aa  299  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  45.69 
 
 
408 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  42.52 
 
 
452 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.02 
 
 
401 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.18 
 
 
392 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  39.57 
 
 
382 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.49 
 
 
395 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.06 
 
 
400 aa  296  7e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.4 
 
 
400 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  41.31 
 
 
439 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.5 
 
 
400 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  41.29 
 
 
468 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.38 
 
 
399 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>