More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2926 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
553 aa  1118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  67.15 
 
 
552 aa  732  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  82.31 
 
 
554 aa  915  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  60.04 
 
 
550 aa  676  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  59.96 
 
 
555 aa  695  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  72.78 
 
 
554 aa  797  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  47.55 
 
 
558 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  47.28 
 
 
558 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  46.91 
 
 
558 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  46.74 
 
 
558 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
569 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  47.18 
 
 
593 aa  515  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  48.21 
 
 
561 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  47.54 
 
 
533 aa  507  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  44.08 
 
 
549 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.79 
 
 
564 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  41.71 
 
 
560 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.70726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.83 
 
 
555 aa  467  1e-130  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  40.83 
 
 
555 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  41.91 
 
 
555 aa  459  1e-128  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  41.19 
 
 
555 aa  461  1e-128  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.00194e-06  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  41.01 
 
 
555 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  40.83 
 
 
553 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.54754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  42.12 
 
 
554 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 
560 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  42.13 
 
 
554 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  39.46 
 
 
618 aa  452  1e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
555 aa  454  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
554 aa  454  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
553 aa  452  1e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  40.26 
 
 
554 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.45039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 
558 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.34796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.24 
 
 
555 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.88 
 
 
555 aa  440  1e-122  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 
555 aa  438  1e-122  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.57483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.06 
 
 
555 aa  441  1e-122  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  40.11 
 
 
559 aa  441  1e-122  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  38.88 
 
 
555 aa  440  1e-122  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.49 
 
 
551 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.49 
 
 
551 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 
551 aa  435  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  38.8 
 
 
583 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  38.7 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  1.58477e-13 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  40.47 
 
 
561 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29936e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.92634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  4.19922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  38.52 
 
 
556 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  40.72 
 
 
553 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  38.87 
 
 
565 aa  417  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  38.87 
 
 
565 aa  417  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
555 aa  417  1e-115  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.64083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 
555 aa  417  1e-115  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 
548 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  39.86 
 
 
556 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 
551 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.7363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.94 
 
 
560 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.67 
 
 
547 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.97 
 
 
578 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
566 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 
560 aa  408  1e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
556 aa  406  1e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
591 aa  408  1e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 
572 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  41.77 
 
 
550 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  42.07 
 
 
568 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 
546 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
554 aa  399  1e-110  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.29126e-07  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.84 
 
 
631 aa  399  1e-110  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  42.36 
 
 
562 aa  402  1e-110  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
561 aa  399  1e-110  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  41.08 
 
 
546 aa  399  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 
562 aa  399  1e-110  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  39.01 
 
 
559 aa  400  1e-110  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  34.05 
 
 
557 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.94402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  35.65 
 
 
677 aa  395  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  42.12 
 
 
590 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  1.43957e-06 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.05 
 
 
557 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  41.49 
 
 
561 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
561 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 
557 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  42.68 
 
 
644 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.41022e-05  unclonable  2.10768e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  41.68 
 
 
550 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 
561 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.23 
 
 
557 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.37244e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
561 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  35.65 
 
 
662 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  7.02612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.05 
 
 
557 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 
557 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>