55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2892 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 167 aa  346  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  91.62 
 
 		 167 aa  323  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  90.79 
 
 		 162 aa  290  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  83.85 
 
 		 162 aa  282  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  77.84 
 
 		 167 aa  277  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  82.35 
 
 		 162 aa  271  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.61 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.67 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.19 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  68.25 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  70 
 
 		 140 aa  187  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.17 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.43 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.97 
 
 		 145 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.69 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.97 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.66 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.25 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.9 
 
 		 107 aa  90.5  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 114 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.63 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.27 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.38 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.09 
 
 		 105 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.94 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.28 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  42.62 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 610 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.62 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 672 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.58 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 77 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 		 77 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 84 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 602 aa  41.6  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  39.71 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.71 
 
 		 77 aa  40.8  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  39.06 
 
 		 272 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 90 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>