31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2859 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  66.41 
 
 		 260 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  56.2 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  53.94 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  53.17 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  49.81 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  51.76 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  50.38 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  45.72 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  44.88 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  45.67 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  47.45 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  42.29 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  42.29 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  41.04 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  42.91 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  45.42 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  43.7 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  43.28 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  35.12 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  37.65 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  35.23 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  35.79 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  34.35 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  32.68 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  36.8 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  29.92 
 
 		 337 aa  92.4  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  28.94 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  23.1 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  36.05 
 
 		 295 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>