More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2848 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  77.38 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  65.16 
 
 		 224 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  54.75 
 
 		 221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  53.85 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  54.26 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  47.96 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  42.47 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  45.03 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  44.5 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  42.41 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  43.01 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  41.09 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  42.86 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.71 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.71 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  36.45 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  41.14 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  38.51 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  38.73 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  40.19 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  41.34 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  38.25 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  41.21 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  48.12 
 
 		 145 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  38.86 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  37.02 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  36.47 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.81 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.79 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.79 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.79 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.79 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.79 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.79 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.53 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.33 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  32.88 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  32.88 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  33.88 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.03 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  36.23 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 162 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.85 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  39.69 
 
 		 154 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 147 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 147 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 162 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 144 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 144 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  32.98 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  30.41 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.98 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 133 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.36 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.37 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.29 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  36.3 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.94 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.51 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.11 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  35.43 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.61 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  34.78 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2104  signal-transduction protein  32.12 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.33 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  31.34 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  35.07 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.61 
 
 		 309 aa  72  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.37 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 154 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.92 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>