More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2820 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  94.51 
 
 
346 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  95.66 
 
 
346 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
346 aa  693    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  97.69 
 
 
346 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  86.71 
 
 
346 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  82.95 
 
 
346 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  72.35 
 
 
343 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  69.86 
 
 
347 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  70.72 
 
 
347 aa  497  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  71.01 
 
 
347 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  71.59 
 
 
347 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  71.1 
 
 
347 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  71.01 
 
 
347 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  71.01 
 
 
347 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
344 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  67.16 
 
 
344 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  66.28 
 
 
344 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  68.99 
 
 
347 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  66.28 
 
 
344 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
344 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  67.25 
 
 
344 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  66.28 
 
 
344 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
344 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  64.64 
 
 
348 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  63.45 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 
346 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 
343 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  63.42 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  61.83 
 
 
343 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  65.24 
 
 
347 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  59.24 
 
 
343 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
348 aa  434  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 
342 aa  434  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  61.99 
 
 
354 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  61.99 
 
 
346 aa  431  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  60.29 
 
 
343 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  64.63 
 
 
347 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  64.63 
 
 
347 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  64.94 
 
 
347 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.83 
 
 
344 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 
348 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  63.96 
 
 
347 aa  428  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 
343 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 
347 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  64.44 
 
 
348 aa  427  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  63.47 
 
 
336 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  63.85 
 
 
344 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  63.72 
 
 
347 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  64.02 
 
 
347 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  63.83 
 
 
347 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  59.05 
 
 
343 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  63.72 
 
 
347 aa  424  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  61.99 
 
 
346 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  60.71 
 
 
368 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  59.12 
 
 
343 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.18 
 
 
350 aa  421  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  61.86 
 
 
347 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
347 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  61.86 
 
 
347 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  62.92 
 
 
348 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  58.31 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  58.21 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
352 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 
347 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  60.79 
 
 
349 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60 
 
 
344 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.77 
 
 
344 aa  411  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  60.73 
 
 
345 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  60.73 
 
 
345 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 
349 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
352 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 
340 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  63.72 
 
 
347 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  59.36 
 
 
347 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  59.48 
 
 
347 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  62.2 
 
 
345 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>