More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2810 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  80.57 
 
 
282 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  77.06 
 
 
285 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  54.05 
 
 
311 aa  295  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  53 
 
 
276 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  55.2 
 
 
272 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  50.38 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  51.29 
 
 
266 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  48.86 
 
 
288 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  50 
 
 
276 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  49.62 
 
 
272 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  48.48 
 
 
278 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  50.38 
 
 
278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  45.85 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  48.86 
 
 
272 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  45.49 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  50.92 
 
 
259 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  49.45 
 
 
259 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  49.45 
 
 
259 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  40.44 
 
 
267 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.35 
 
 
270 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  44.93 
 
 
268 aa  215  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  42.76 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  41.43 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  39.78 
 
 
258 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  44.09 
 
 
265 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  42.14 
 
 
268 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  45.52 
 
 
279 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  45.52 
 
 
279 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  50.18 
 
 
259 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  43.06 
 
 
272 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  40.07 
 
 
268 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  41.43 
 
 
273 aa  202  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  45.53 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  41.01 
 
 
267 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  43.37 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  42.12 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.94 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  39.08 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.18 
 
 
275 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.18 
 
 
275 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  40.65 
 
 
274 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  43.17 
 
 
264 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  45.52 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  39.78 
 
 
261 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  38.99 
 
 
267 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  38.85 
 
 
272 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  38.63 
 
 
264 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.02 
 
 
295 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  38.43 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  38.87 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  35.64 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  40.44 
 
 
291 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.09 
 
 
264 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  37.82 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  35.32 
 
 
264 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  40.78 
 
 
282 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  40.38 
 
 
270 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.11 
 
 
266 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.11 
 
 
266 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  36.36 
 
 
289 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  38.81 
 
 
281 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  39.55 
 
 
295 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  38.86 
 
 
281 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  34.26 
 
 
284 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  36.9 
 
 
267 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  43.46 
 
 
268 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  41.11 
 
 
263 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  35.23 
 
 
273 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  39.8 
 
 
259 aa  166  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  39.15 
 
 
254 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  34.3 
 
 
267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  38.43 
 
 
281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.48 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  34.46 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  39.58 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  39.48 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  39.27 
 
 
280 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  39.27 
 
 
280 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  34.3 
 
 
267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  39.93 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  34.08 
 
 
269 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  34.43 
 
 
295 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  36.82 
 
 
276 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  36.82 
 
 
276 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  36.82 
 
 
276 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.15 
 
 
277 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.57 
 
 
265 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  40.3 
 
 
270 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  37.16 
 
 
303 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  41.13 
 
 
293 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  38.91 
 
 
280 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  37.38 
 
 
271 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>