More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2788 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  89.71 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  86.01 
 
 		 243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  73.66 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  69.29 
 
 		 242 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  69.14 
 
 		 242 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  67.22 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  66.67 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  67.63 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  67.36 
 
 		 263 aa  345  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  67.77 
 
 		 258 aa  344  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  66.39 
 
 		 242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  66.94 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  67.49 
 
 		 242 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  67.9 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  67.08 
 
 		 250 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  66.12 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  67.66 
 
 		 267 aa  339  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  66.12 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  66.67 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  66.53 
 
 		 263 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  65.56 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  65.84 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  64.46 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  64.61 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  65.15 
 
 		 246 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  64.2 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  64.61 
 
 		 252 aa  334  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  67.23 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  65.96 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.79 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  67.09 
 
 		 259 aa  331  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  65.15 
 
 		 253 aa  331  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  64.17 
 
 		 258 aa  331  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  64.17 
 
 		 258 aa  331  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.37 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  65.29 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  65.96 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  63.33 
 
 		 269 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  65.83 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  65 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  64.2 
 
 		 245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  64.26 
 
 		 258 aa  328  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  64.32 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  64.32 
 
 		 253 aa  327  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  65.25 
 
 		 257 aa  327  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  65.42 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  64.68 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  65.42 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  64.83 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  65.15 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  63.07 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  63.75 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  64.68 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  65.43 
 
 		 255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.17 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  63.33 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  64.32 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  65.53 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  63.9 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  65.42 
 
 		 249 aa  325  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  64.14 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  62.87 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.2 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  66.67 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 		 254 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  63.9 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  64.56 
 
 		 247 aa  324  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  63.49 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  64.56 
 
 		 247 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  62.4 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  64.2 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  63.49 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  63.49 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.73 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  64.14 
 
 		 246 aa  323  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  62.14 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  65 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  63.79 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.64 
 
 		 266 aa  321  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  65.02 
 
 		 257 aa  321  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.32 
 
 		 253 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  320  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  63.75 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  64.73 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.9 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  63.49 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  61.98 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 245 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>