More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2735 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
384 aa  771    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  54.06 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2366  TPR repeat-containing protein  46.36 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.062914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
629 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
878 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
3145 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
649 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 
810 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 
632 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
927 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 
1056 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
818 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 
988 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
784 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 
1056 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.9 
 
 
1022 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.22 
 
 
820 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.69 
 
 
795 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  26.71 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
1737 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
1276 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.28 
 
 
875 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 
762 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
1421 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
639 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 
1694 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 
576 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
718 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.63 
 
 
626 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.36 
 
 
626 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 
689 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
4079 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  26.96 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 
1979 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
847 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
636 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
612 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
611 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.37 
 
 
707 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
637 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
827 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
634 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.19 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.93 
 
 
623 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.5 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 
1252 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
824 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1094 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
615 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
3301 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.46 
 
 
706 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.59 
 
 
1154 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
750 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.63 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
301 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  25.55 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.06 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.83 
 
 
1007 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.53 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.2 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.54 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
715 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
3035 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
879 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
602 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
909 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.75 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>