280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2722 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 487 aa  1014    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 		 462 aa  227  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.2 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 453 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  26.41 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  28.21 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  25.17 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  21.26 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  21.26 
 
 		 450 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  26.99 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.54 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.92 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.92 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.92 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.92 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.92 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  23.2 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  25.84 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.27 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.92 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.27 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>