More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2683 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1358 aa  2725    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.34 
 
 
1301 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
778 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1559 aa  365  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1079 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
978 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
975 aa  353  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 
1101 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1120 aa  352  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 
902 aa  347  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.64 
 
 
1055 aa  342  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.89 
 
 
957 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
837 aa  334  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
1000 aa  333  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1078 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  45.91 
 
 
742 aa  331  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 
869 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.36 
 
 
982 aa  325  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
1044 aa  320  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
957 aa  320  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
705 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  47.01 
 
 
733 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  42 
 
 
1193 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1096 aa  314  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
963 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 
1070 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
1050 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.42 
 
 
1535 aa  313  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
1005 aa  311  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
678 aa  311  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
940 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1177 aa  310  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1433 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
918 aa  307  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1007 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
1199 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
862 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
676 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
788 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  40.18 
 
 
816 aa  305  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.44 
 
 
772 aa  304  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
1407 aa  303  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
705 aa  301  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
939 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
1055 aa  300  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
1363 aa  298  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  39.5 
 
 
816 aa  298  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
947 aa  297  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
743 aa  297  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 
846 aa  297  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
896 aa  296  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
1039 aa  296  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
955 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
947 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.07 
 
 
882 aa  295  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
643 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
881 aa  294  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
1143 aa  294  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
643 aa  294  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
704 aa  294  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
643 aa  294  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
969 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1071 aa  293  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1195 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.59 
 
 
666 aa  293  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 
643 aa  293  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  39.45 
 
 
606 aa  292  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
952 aa  291  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
877 aa  290  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.23 
 
 
651 aa  290  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
631 aa  290  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
979 aa  290  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
893 aa  287  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41 
 
 
651 aa  287  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
762 aa  287  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  44.39 
 
 
793 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
902 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1044 aa  287  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  40.67 
 
 
900 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
765 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1118 aa  286  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
839 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554495  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
767 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
738 aa  284  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  38.08 
 
 
671 aa  284  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  40.83 
 
 
661 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.98 
 
 
763 aa  284  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
882 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
873 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
1324 aa  283  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
837 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
973 aa  282  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1222 aa  282  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
667 aa  282  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.94 
 
 
968 aa  282  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  38.35 
 
 
758 aa  281  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1116 aa  281  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1075 aa  281  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 
962 aa  280  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
633 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>