277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2681 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  100 
 
 
561 aa  1120    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  48.12 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  36.11 
 
 
449 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  34.12 
 
 
453 aa  259  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  36.77 
 
 
446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  39.54 
 
 
425 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  35.9 
 
 
397 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  36.13 
 
 
479 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  36.24 
 
 
446 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  37.47 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  32.29 
 
 
487 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  29.05 
 
 
442 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  30.34 
 
 
450 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  29.75 
 
 
451 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  30.95 
 
 
452 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  31.56 
 
 
439 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  29.71 
 
 
459 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  28.37 
 
 
447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  33.43 
 
 
430 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  29.71 
 
 
422 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  27.69 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  32.02 
 
 
472 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  30.84 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  29.68 
 
 
460 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  31.28 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.68 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  31.54 
 
 
429 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.68 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  33.33 
 
 
297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 
538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  29.7 
 
 
411 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.99 
 
 
408 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.96 
 
 
405 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  30.55 
 
 
411 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.67 
 
 
411 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  31.27 
 
 
434 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.48 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  31.43 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  29.08 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  31.3 
 
 
337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.82 
 
 
298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  33.06 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.67 
 
 
445 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  30.89 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  30.89 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  30.89 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  30.89 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  30.89 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.53 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.45 
 
 
337 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.76 
 
 
336 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  32.14 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.35 
 
 
285 aa  114  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  30.49 
 
 
290 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  31.47 
 
 
340 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.98 
 
 
443 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  34.66 
 
 
286 aa  113  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.71 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  30.2 
 
 
313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.09 
 
 
447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2625  tRNA-processing RNAse BN  31.78 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.8 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  37.6 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  29.39 
 
 
323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.31 
 
 
310 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  29.39 
 
 
323 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  29.39 
 
 
323 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  30.08 
 
 
290 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  29.72 
 
 
443 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  29.01 
 
 
323 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.98 
 
 
443 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  28.68 
 
 
294 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  32.37 
 
 
441 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  29.44 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  31.75 
 
 
429 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  29.92 
 
 
442 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  28.8 
 
 
300 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  31.35 
 
 
429 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  28.09 
 
 
439 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  30.28 
 
 
443 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.77 
 
 
437 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  31.68 
 
 
404 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.75 
 
 
444 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.42 
 
 
436 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  29.09 
 
 
442 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  27.2 
 
 
296 aa  107  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  29.09 
 
 
442 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.8 
 
 
404 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  29.17 
 
 
442 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  25.76 
 
 
405 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.85 
 
 
437 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>