More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2550 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
685 aa  1377    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.32 
 
 
653 aa  879    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.49 
 
 
657 aa  934    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 
650 aa  692    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
528 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0576  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
507 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2549  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 
446 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 
501 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3717  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 
401 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
1028 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
567 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 
681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1223  anti-sigma-factor antagonist  54.55 
 
 
271 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 
237 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  51.24 
 
 
233 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  47.06 
 
 
461 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 
760 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 
861 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 
756 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 
612 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.3 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0410  anti-sigma-factor antagonist  41.55 
 
 
238 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 
826 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  26.33 
 
 
1427 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 
853 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4410  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.59 
 
 
444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.67 
 
 
457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
1426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.96 
 
 
608 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.96 
 
 
608 aa  112  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.96 
 
 
608 aa  112  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.96 
 
 
608 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.96 
 
 
608 aa  112  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.31 
 
 
608 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.48 
 
 
739 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.15 
 
 
458 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.01 
 
 
455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1042  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.17 
 
 
444 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.17 
 
 
685 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.43 
 
 
444 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.22 
 
 
457 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3995  helix-turn-helix, Fis-type  45.83 
 
 
444 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0385153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.31 
 
 
466 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.01 
 
 
455 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.98 
 
 
444 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.28 
 
 
859 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 
455 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.17 
 
 
444 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3740  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.18 
 
 
454 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0840186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.17 
 
 
444 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
508 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
347 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.91 
 
 
452 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.3 
 
 
457 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
347 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.3 
 
 
458 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.91 
 
 
500 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1081  two component  44.8 
 
 
441 aa  107  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136641  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  30.17 
 
 
516 aa  107  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.8 
 
 
477 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.8 
 
 
473 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
544 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.97 
 
 
447 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.75 
 
 
362 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4292  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  44.17 
 
 
444 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.18 
 
 
462 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
361 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.65 
 
 
460 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1196  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator  41.1 
 
 
448 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.13 
 
 
456 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
494 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.88 
 
 
451 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 
453 aa  104  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18020  sigma54-dependent response regulator of C4 dicarboxylate transport, two component; DctD  47.41 
 
 
446 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.65 
 
 
491 aa  104  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.59 
 
 
451 aa  104  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  35.98 
 
 
465 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.4 
 
 
491 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
511 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.95 
 
 
456 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
509 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2103  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.51 
 
 
467 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705186  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.32 
 
 
453 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3351  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45 
 
 
465 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.58 
 
 
335 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
692 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  35.14 
 
 
544 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 
733 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.59 
 
 
456 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  46.09 
 
 
456 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4689  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 
447 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.75 
 
 
314 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.49 
 
 
465 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
671 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1461  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.98 
 
 
445 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0783973  normal  0.675596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
360 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.31 
 
 
455 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.090562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>