More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2541 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 874 aa  1747    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  41.24 
 
 		 867 aa  271  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 827 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 701 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 1516 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1363 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 637 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 1042 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1039 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 458 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 1959 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 609 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 1291 aa  187  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 885 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 712 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 815 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1029 aa  180  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 3470 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 1207 aa  178  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1178 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 725 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 737 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 444 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  40.82 
 
 		 470 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 754 aa  174  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 2783 aa  174  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1002 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 611 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 619 aa  172  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 1177 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.62 
 
 		 617 aa  171  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  32.22 
 
 		 613 aa  170  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 1193 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 446 aa  170  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 2161 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 453 aa  170  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 833 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 905 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 757 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 592 aa  168  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  32.5 
 
 		 613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.65 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  32.5 
 
 		 613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 917 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 884 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 584 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 839 aa  165  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1643 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 827 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  32.5 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 1079 aa  164  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 489 aa  164  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 958 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 1053 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 608 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  28.49 
 
 		 608 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  32.22 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 911 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  32.22 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 778 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 632 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  32.22 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  37.65 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 1015 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.06 
 
 		 1629 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.31 
 
 		 587 aa  163  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.31 
 
 		 591 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.31 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1021 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 584 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  37.65 
 
 		 587 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 880 aa  162  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  29.17 
 
 		 610 aa  161  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  37.65 
 
 		 587 aa  162  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  37.65 
 
 		 587 aa  161  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  37.65 
 
 		 587 aa  161  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  37.65 
 
 		 587 aa  162  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 953 aa  162  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 589 aa  162  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  28.45 
 
 		 599 aa  161  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 2153 aa  161  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 569 aa  161  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.65 
 
 		 587 aa  161  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 599 aa  161  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 587 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  40.87 
 
 		 461 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  41.13 
 
 		 461 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  41.13 
 
 		 461 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 621 aa  160  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  41.56 
 
 		 464 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.49 
 
 		 2213 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>