More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2540 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  70.07 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  65.03 
 
 		 149 aa  193  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  65.69 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  62.04 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  62.33 
 
 		 148 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  60.84 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  62.59 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  64.23 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  58.99 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  60.43 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.71 
 
 		 146 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  62.04 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  62.32 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  60.43 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  58.87 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  57.53 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  57.45 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  56.85 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  58.7 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  55.48 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  55.48 
 
 		 148 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  61.03 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  57.55 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  59.85 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  57.25 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  56.43 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  51.8 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  57.04 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  56.93 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  54.68 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  53.79 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  54.11 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  54.79 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  51.37 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  53.42 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  53.24 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  47.22 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 146 aa  130  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  45 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  50.71 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 167 aa  127  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  48.25 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  45.52 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  46.81 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 173 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  45 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  46.1 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  45 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  41.67 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 153 aa  120  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  45 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  45 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  45.11 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  43.88 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  44.03 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  48.12 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>