More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2535 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.9 
 
 		 390 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  26.88 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.13 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  23.49 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  27.04 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.13 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  33.15 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 305 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.78 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  36.62 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.61 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.08 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.58 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  26.75 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.54 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30.86 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 337 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.67 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  38.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.13 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.11 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.83 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  36.46 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  34.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  34.51 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.94 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  32.67 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.61 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  38.78 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  32.45 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  45.61 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  31.2 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.93 
 
 		 672 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.35 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  24.67 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  24.53 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>