38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2514 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  74.32 
 
 		 76 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  51.39 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2413  hypothetical protein  44.78 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  46.38 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  41.18 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  46.67 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  39.19 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  40.79 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  43.86 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  45.76 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  44.26 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  46.15 
 
 		 524 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  44.26 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  37.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  31.15 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  46.3 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  48.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  39.39 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  43.55 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  38.1 
 
 		 90 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  42.59 
 
 		 197 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  45.61 
 
 		 205 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  40.74 
 
 		 203 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  38.16 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.38 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  37.1 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  42.37 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.67 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  40.28 
 
 		 139 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>