More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2513 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 686 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 688 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 945 aa  660    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  64.29 
 
 		 883 aa  778    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 880 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 969 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 896 aa  652    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 720 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 		 868 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 		 964 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 		 686 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 889 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 964 aa  653    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 1029 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 885 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 956 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 		 686 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 686 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 686 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 880 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 		 686 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  72.68 
 
 		 892 aa  925    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  57.59 
 
 		 884 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  56.16 
 
 		 904 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.13 
 
 		 882 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  57.26 
 
 		 966 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 922 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 971 aa  727    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 975 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 894 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  49.18 
 
 		 970 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 898 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  60.47 
 
 		 947 aa  722    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 972 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 891 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 880 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  63.24 
 
 		 884 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  71.33 
 
 		 984 aa  1010    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 		 686 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 975 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.17 
 
 		 948 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 		 876 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  58.38 
 
 		 980 aa  767    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  59.66 
 
 		 903 aa  694    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 976 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.91 
 
 		 692 aa  675    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 901 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.97 
 
 		 880 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 975 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1079 aa  2128    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 885 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 894 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.01 
 
 		 907 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 986 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.34 
 
 		 989 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 		 884 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 705 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.94 
 
 		 843 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 880 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 949 aa  741    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  55.68 
 
 		 979 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 895 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50 
 
 		 1011 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 971 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 975 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 971 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  55.69 
 
 		 946 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 869 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 965 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  49.52 
 
 		 1008 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  45.78 
 
 		 1161 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 972 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 896 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  60.28 
 
 		 732 aa  691    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 885 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 885 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 		 896 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 881 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.63 
 
 		 882 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  78.18 
 
 		 997 aa  1043    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  55.75 
 
 		 971 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 705 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  67.59 
 
 		 1079 aa  1263    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 992 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  56.68 
 
 		 968 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 985 aa  738    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 		 845 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 689 aa  653    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 971 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  63.29 
 
 		 962 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.29 
 
 		 949 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 889 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 964 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 882 aa  771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  61.39 
 
 		 921 aa  751    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  56.82 
 
 		 688 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  56.88 
 
 		 822 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>